清朝末年，清政府知道很多边境地区岌岌可危，想尽办法去整顿。然而因为没有实力，也没有真正有能力能办事的人，想整顿，没有真正有能力能办事的人，于是所做的很多事情都流于形式，不能真正解决问题;有的做法还骚扰了边境地区的人们的生活，激起了当地人们的反抗，后来不得不采取高压手段，导致边境地区问题越来越严重。没有实力用高压手段，常常因力不从心招致边境地区少数民族贵族阶层的叛离。外蒙就是由杭达亲王为代表，和俄国人勾结，宣布独立，把清政府办事大臣三多驱逐出境。宣布独立后，又派兵攻陷呼伦贝尔。
这个时候，国内革命军的起义活动风起云涌，清政府无法顾及外蒙的事情，对外蒙独立的事情置之不理。
后来俄国向清政府提出要求。要求如下:
(一)承认俄国从库伦到俄国的筑路权。
(二)中蒙订约，申明:(A)中国不在蒙古驻兵。(B)殖民。(C)允许蒙人自治。(三)中国如在蒙古改革，须得先同俄国商量。清政府忙于应付国内革命军日益严重的起义活动，对俄国所提要求置之不理。
民国初立，中国国内混乱不堪，没有人去过问蒙古的事情，当时只是少数人偶尔议论而已。后来，俄国参赞廓索维慈和库伦订立《协约》。俄国帮助外蒙古，保证它的自治;训练军队，不允许中国派兵到外蒙古驻军，而外蒙古则允许俄国人有《附约》(《俄蒙商务专条》)上的权利。《附约》上的权利有:
(一)俄国人可以在外蒙古自由居住活动;经商办企业和其它各种事情。
(二)俄国人与外蒙古通商免税。
(三)俄国银行可以在外蒙古设立分行。
(四)俄国人可以在外蒙古租地，买地，建筑工厂、商铺、房屋、货栈和租地耕种。(五)俄国人可以在外蒙古经营矿业、森林业、渔业。
(六)设立贸易区域，方便俄国人营业居住。
(七)俄国人可以在外蒙古设立邮政局。
(八)俄国领事可以免费使用外蒙古台站。俄国私人只要交费，也可以使用。
(九)外蒙古河流流入俄国的，俄国人在其本支流内，可以自由航行
(十)俄国人可以在外蒙古修桥，而且向通过桥上的行人收取费用。
(十一)由俄国领事与外蒙古官员组织成立会审委员会，审理俄蒙人的争议。
同时向中国、日本、英国发出通告。中国接到通告后，舆论哗然，一时间征讨外蒙古的讨论甚嚣尘上。当时的外交总长陆征祥，前后和俄国人谈判二十多次，最后将谈判签订的《草约》提交国会，众议院通过，参议院否决。当时的赵内阁倒台后，熊内阁成立。孙宝琦做外交总长后，继续和俄国人谈判，俄国人坚持已经确定的《草约》条款不能改变 。最后孙宝琦和俄国大使库朋斯齐签订条约，条约的主要内容是:
(一)俄国人承认中国在外蒙古的宗主权。(二)中国承认外蒙古的自治权。
(三)中国对外蒙古不派兵，不派官员，不殖民。只可任命大员偕同属员卫队，驻扎在库伦。可以派专员驻扎外蒙古各地方，保护中国人的利益。俄国除领事暑的卫队外，不驻兵;不干涉外蒙古内政;不殖民。
(四)中国声明按照以前各款大纲及一九一二年十月二十一日的《俄蒙商务专条》确定中国和外蒙古的关系。
(五)凡关于俄国及中国在外蒙古的利益，因形势变化另行商定。以照会的形式声明:(A)俄国承认外蒙古为中国领土的一部分。(B)关于外蒙古政治、土地、外交事宜，中国应和俄国进行协商，外蒙古也要参与。(C)正文第五款所说随后商订的事宜，由三方商定地点，派代表谈判确定。(D)自治区域，以前清库伦大臣、乌里雅苏台将军、科布多大臣所管辖的地方为界限。边界划定工作，按照声明文件第三款规定，日后再进行商定。因第(五)款的原因，中国派毕桂芳、陈箓和俄国库伦总领事亚历山大密勒尔及外蒙古的委员，在恰克图进行谈判。经过谈判订立《中俄蒙协约》。主要内容是:
外蒙古没有与各国订结政治土地国际条约的权利，有与外国订立关于工商事宜的国际条约的权利。中国驻库伦大员及卫队以二百人为上限，驻乌里雅苏台、科布多、恰克图的以五十人为上限。
俄国驻库伦领事卫队以五十人为上限，驻扎他处的同上。划界问题，由三国另派代表，协商办理。
呼伦贝尔也因俄国人要求，订立改为特别地域的条约。条约主要内容是:
(一)呼伦贝尔为特别地域，直属中华民国政府。
(二)呼伦贝尔副都统由总统选择该地三品以上的蒙古官员直接任命;有与省长同等的权利。
(三)呼伦贝尔军队，全用本地民兵。遇到有变乱，不能自己平定，中国通知俄国后，可以援助，但平定后立即撤兵。
(四)呼伦贝尔的收入，全部作为地方经费。
(五)中国人在呼伦贝尔，仅有借住权。
(六)将来外蒙古建设铁路，借款应先借俄国的。
(七)俄国的企业家和呼伦贝尔官方订立的契约，经中俄两国委员会审查，中国政府应立即给予承认。
内蒙古的王公贵族，要求归中国政府管理的态度很坚决，1912年在长春组织蒙旗会议，中国政府派阿睦尔灵圭和东三省宣抚使张锡銮、吉林都督陈昭常参加，后来内蒙古王公贵族又组织蒙古联合会，发表宣言，当时在外国的报纸上都有报道。
民国初期内蒙古及科布多、乌梁海、青海、新疆各盟均赞成共和，要求归当时的中国政府管辖。只有外蒙古的活佛勾结外蒙古王公贵族妄称独立，其实外蒙古四个部落，迤西两部各旗当时并未同意独立，宣布独立的只是库伦附近各旗和活佛;在当时的全体蒙古人中，同意并宣布独立的人占全部人数的比例还不到十分之一。后来库伦伪政府与俄国擅自订立《协约》，竟然宣称代表全体蒙古人，这种行为十分可耻。当时成立的蒙古联合会坚决不承认库伦的伪政府具有代表蒙古的资格，宣布伪政府与外国协商订立的条约一律无效。
内蒙的宣言，没有起到多大的作用，没能改变外蒙古独立的事实。库伦独立后，曾派兵向南进犯内蒙古，被当时的中国政府派热河、绥远、山西的驻军联合内蒙古军队击退。当时内蒙古有极少的部落也不时闹独立，像科尔沁右翼前旗的乌泰。
郑家屯本哲里木盟这个地方，1913年改为辽源县。袁世凯称帝失败后，日人在当时的南满搞各种阴谋活动，意图控制当时的南满。当时亡清的肃亲王善耆居住在大连，日本人经常资助他的各种活动，给巴布札布提供军火，并在辽源擅自设置警察署。巴布札布曾侵犯过当时的热河，被都统姜桂题派兵击退，后来又率蒙匪侵犯当时的突泉，被第二十八师冯麟阁打败，后来日人对外宣布南满铁路附近不能打仗，阻止奉军追袭巴布扎布，当时二十八师驻扎在郑家屯，因为郑家屯日本警察和中国驻军发生冲突，日本要求二十八师和其余的中国官兵一律退出郑家屯外三十里，日本派兵将郑家屯占为己有。蒙匪在这个时候，退至郑家屯附近的郭家店。日本人和奉天督军张作霖进行交涉，要求允许蒙匪退回蒙古境内，中国军队不能追剿，张作霖被逼同意，在蒙匪退却的时候，日军夹杂在蒙匪中间，说是监视行动，实际上是有侵占中国领土的意图。后来张作霖通告日本，揭破其阴谋，并且说现在的情形如此危急，不得不加以讨伐。但是在张作霖进兵的时候，蒙匪中忽然升起了日本国旗，被中国炮弹击穿，日本又以此为借口把军队调集朝阳坡，并声称要攻击奉天，没有办法奉军只好撤退，以保护奉天。对郑家屯事件，以中国处罚军官并向日本道歉，日本人才善罢甘休。
